Uprava društva Mercator BH utvrđuje viziju, poslanstvo, vrijednosti, politiku i strategiju za njihovo ostvarivanje u okviru društva. Na taj način, obezbjeđuje ostvarivanje poslanstva, vrijednosti i politike Mercator BH na području Federacije Bosne i Hercegovine.

Politika i ciljevi su razrađeni u planovima na različitim nivoima rukovođenja, tako da je određena njihova vrijednost, a njihovo ostvarivanje mjereno na odgovarajući način i adekvatno analizirano.
 

Upravu društva čine Direktor društva i Pomoćnik direktora društva koji upravljaju društvom i zastupaju društvo.